Breast Cancer(SMC 2018)

发布时间:2024-01-24浏览量:



1. 数据集名称:

Breast Cancer(SMC 2018)

2. 数据集基本情况:

• 项目背景:

亚太地区的乳腺癌 (BC) 在年轻患者中出现概率很高,发病率迅速上升,但其分子层面的研究基础仍然很少。作者分析了来自绝经前患者的韩国 BC 队列 (SMC) 的 187 个原发肿瘤的整个外显子组和转录组,并与白种人和绝经后 BC 队列 (TCGA) 进行系统比较。

• 样本量:

– 病人数量: 187名患者

– 临床数据特征数:14项

– 可视化数据种类:11种

• 其他重要信息:

– SMC队列主要为绝经前(88.2%),而TCGA队列主要为绝经后(72.3%)

– 与TCGA相比,SMC拥有更多细胞周期检查点通路的改变(LR:p = 0.019)

– SMC 中 Luminal B 与 Luminal A 的富集可能是由于 TP53 突变和 ERBB2 扩增的患病率较高

3. 适用任务:

• 乳腺癌 (BC)多组学分析

4. 下载地址:

• https://www.cbioportal.org/study/summary?id=brca_smc_2018

如下图:在cBioPortal for Cancer Genomics网站Breast类中找到Breast Cancer(SMC 2018)或者在搜索栏直接输入名称,点击“Explore Selected Studies”即可下载。

5. 文献出处:

• Kan Z, Ding Y, Kim J, Jung HH, Chung W, Lal S, et al. Multi-omics profiling of younger Asian breast cancers reveals distinctive molecular signatures. Nat Commun. 2018 Apr 30;9(1):1725. doi: 10.1038/s41467-018-04129-4. PMID: 29713003; PMCID: PMC5928087.