1. 数据集名称:

MSK MetTropism(MSK, Cell2021): MSK-MET (Memorial Sloan Kettering - Metastatic Events and Tropisms)

2. 数据集基本情况:

• 项目背景:

该数据集来自美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSK），利用复杂的计算技术，从MSK-IMPACT中提取数据。MSK-IMPACT是一种独特的工具，用于寻找400多个癌症相关基因的突变，并帮助临床医生根据单个基因组改变选择治疗方案。

• 样本量:

– 病人数量: 25000名患者

– 临床数据特征数：22项

– 相关癌症种类：27种

– 可视化数据种类：24种

• 其他重要信息:

– 作者分析了该数据集，以确定肿瘤基因组改变与 50 种肿瘤类型转移扩散模式之间的关联，并发现，染色体不稳定与某些肿瘤类型的转移负荷密切相关，包括前列腺腺癌、肺腺癌和HR+/HER2+乳腺导管癌，但在其他肿瘤类型中则不相关，如结直肠MSS、胰腺癌和高级别浆液性卵巢癌。

– 作者还确定了与转移负荷增加相关的特定体细胞改变和转移扩散的特定途径。数据为研究转移扩散的生物学基础提供了独特的资源，并强调了染色体不稳定性在癌症进展中的关键作用

3. 适用任务:

• 50 种肿瘤类型的转移模式肺结节分类

4. 下载地址:

• https://www.cbioportal.org/study/summary?id=msk_met_2021

• 如下图，在cBioPortal for Cancer Genomics网站点击PanCancer Studies，选择MSK MetTropism(MSK, Cell2021)或直接在搜索框内输入全称，点击”Explore Selected Studies”即可下载。

5. 文献出处:

• Nguyen B, Fong C, Luthra A, Smith SA, DiNatale RG, Nandakumar S, et al. Genomic characterization of metastatic patterns from prospective clinical sequencing of 25,000 patients. Cell. 2022 Feb 3;185(3):563-575.e11. doi: 10.1016/j.cell.2022.01.003. PMID: 35120664; PMCID: PMC9147702.