1. 数据集名称:

人类肠道菌群基因组数据库（Mibiogen）

2. 数据集基本情况:

•项目背景:

–近年来，人类微生物群，特别是肠道微生物群，已成为影响人类代谢、免疫学和疾病的重要而复杂的特征。许多研究正在调查观察到的变异背后的力量，包括塑造人类微生物群的人类遗传变异。

–大型研究计划Mibiogen由中科院微生物所王军以及比利时和荷兰的多位科学家发起，旨在从全基因组的层面研究人体基因对肠道菌群的影响。目前MiBioGen已收集了全球18个不同人群，约19000人的肠道菌群和基因组数据，建立了完整、开源、标准化的分析流程。每个队列都通过16S rRNA 测序调查了肠道微生物组，并使用全基因组SNP 阵列对参与者进行了基因分型。

–数据库：https://www.mibiogen.org/

•项目样本量:

–迄今为止最大的致力于微生物群的GWAS数据库

–联盟涉及18 项研究，大多数是欧洲、亚洲和北美国家的前瞻性队列，每个队列研究的人数从139 人到2482 人不等，总共19,790 人（经过质量控制(QC) 后为18,965 人）

–估算后，每项研究产生了约3910 万个SNP

•其他重要信息:暂无

3. 适用任务:

•孟德尔随机化应用及其方法学开发（基于基因分析的流行病学因果证据）

4. 在线地址:

•https://mibiogen.gcc.rug.nl/

5. 文献出处:

•该数据库的构建说明：https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-018-0479-3

•引用该数据库的权威文献：Kurilshikov, A., Medina-Gomez, C., Bacigalupe, R. et al. Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition. Nat Genet 53, 156–165 (2021). https://doi.org/10.1038/s41588-020-00763-1