癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas Program ,TCGA)
发布时间:2023-12-22浏览量:1. 数据集名称:
癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas Program ,TCGA)
2. 数据集基本情况:
•项目背景:
–癌症基因组图谱(TCGA)是一项具有里程碑意义的癌症基因组计划,其分子特征表征了超过20,000种原发性癌症,并匹配了33种癌症类型的正常样本。这项国家癌症所(National Cancer Institute, NCI)和国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)的合作始于2006年,汇集了来自不同学科和多个机构的研究人员.
–起始年份:2006年
•样本量及癌症类型以及相关发表的文章:
–约11000个患者样本。
•数据类型:
–临床信息(如吸烟状况)
–分子分析物元数据(如样品分量)
–分子表征数据(如基因表达值)
注:更详细的分类见:https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga/using-tcga-data/types
•要求/限制
–TCGA对隐私、使用做了非常详尽的说明,详见TCGA Ethics and Policies:https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/tcga/history/ethics-policies
3. 数据申请网站:
•NIHGDCDataPortal: https://portal.gdc.cancer.gov/
4. 申请流程:
进入网站,搜索自己需要的数据,直接下载。