Autism Brain Imaging Data Exchange, ABIDE

发布时间:2023-12-22浏览量:

1. 数据集名称:

Autism Brain Imaging Data Exchange, ABIDE

2. 数据集基本情况:

•项目背景:

–预处理连接组计划( PCP )公开发布和开放共享来自自闭症脑成像数据交换( ABIDE )的预处理神经成像数据。ABIDE是由国际神经影像学数据共享倡议( INDI )的16个国际成像网站合作得到的数据集,这些网站聚合并公开共享来自539名ASD患者和573名典型对照的神经影像学数据。这1112个数据集由结构化的和静息状态的功能磁共振影像数据以及大量的表格数据组成。

•样本量:

–病人数量: 539名

–对照组数量:573名

•其他重要信息:

–PCP的五个不同团队使用他们首选的工具对ABIDE的数据进行了预处理。使用以下工具进行预处理:

①连接组计算系统:the Connectome Computation System (CCS)

②分析连接组的可配置管道:the Configurable Pipeline for the Analysis of Connectomes (CPAC)

③静息态的功能磁共振影像的数据处理助手:the Data Processing Assistant for Resting-State fMRI (DPARSF)

④神经影像分析工具:the NeuroImaging Analysis Kit(NIAK)

–由于带通滤波(bandpass filtering)和全局信号回归(global signal regression)存在争议,每个预处理工具下分别执行4种不同的处理策略:有、无带通滤波和有、无全局信号回归的所有组合。采用3种不同的管道进行结构预处理和皮层测量:ANTS, CIVET和FreeSurfer

预处理管道(preprocessingpipelines)详细介绍见:http://preprocessed-connectomes-project.org/abide/Pipelines.html

–提供了这1112个样本的表格数据,内容包括功能磁共振扫描时的年龄、性别、全量表智商(full scale IQ)、语言智商(verbal IQ)、操作智商(perfomance IQ)等个人信息,以及anat_cnr、anat_efc、anat_fber等质量评估列。

3. 适用任务:

•自闭症预测

4. 下载地址:

•神经影像数据:

http://preprocessed-connectomes-project.org/abide/download.html

•表格数据下载地址:

https://s3.amazonaws.com/fcp-indi/data/Projects/ABIDE_Initiative/Phenotypic_V1_0b_preprocessed1.csv

表格数据每一列的含义:

http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/ABIDE_LEGEND_V1.02.pdf

质量评估列含义详见:

http://preprocessed-connectomes-project.org/abide/quality_assessment.html

5. 文献出处:

•Cameron Craddock, Yassine Benhajali, Carlton Chu, Francois Chouinard, Alan Evans, András Jakab, Budhachandra Singh Khundrakpam, John David Lewis, Qingyang Li, Michael Milham, Chaogan Yan, Pierre Bellec (2013). The Neuro Bureau Preprocessing Initiative: open sharing of preprocessed neuroimaging data and derivatives. In Neuroinformatics 2013, Stockholm, Sweden.

•基于该数据集的自闭症预测精度结果(95.4%)

https://paperswithcode.com/paper/identification-of-novel-diagnostic