英国生物银行(UK Biobank , UKB)
发布时间:2023-12-22浏览量:1. 数据集名称:
英国生物银行(UK Biobank , UKB)
2. 数据集基本情况:
•项目背景:
–英国生物银行(UK Biobank,UKB)是英国迄今以来规模最大的有关致病或预防疾病的基因和环境因子的信息资源库。目的是探求一些特定基因、生活方式和健康状况之间的关系,提高对一些遗传类疾病致病基因的理解,包括癌症、心脏病、糖尿病和一些特定的精神疾病。UK Biobank项目在2006-2010年间共收集英国各地年龄在40 - 69 岁人群中 50 万例志愿者数据信息,包括基因信息和血液样本、生活方式及环境暴露数据,并跟踪记录他们之后数十年的健康医疗档案信息。研究期间,所有疾病、药品处方以及参加者死亡等都将被记录在库,以供英国国家医疗服务体系(NHS)利用并管理,成为了全球最重要的人体生物健康信息库之一。
–起始年份:2006年
–追踪调查年份:2006-2010年
–调查地区:调查在苏格兰、英格兰和威尔士的22个评估中心进行
–入组年龄要求:40-69岁个体
•样本量:
–招募了50万名参与者
–10万名参与者戴着24小时活动监测器一周
–2万名参与者接受了重复测量
–近5万名参与者接受了心脏、脑部和腹部的扫描
•数据类型:
–新数据收集: UK Biobank不断收集关于五十万参与者的广泛环境、生活方式和基因数据,并定期将新数据上传到数据库中。研究人员在新数据发布时会收到通知
–参与者提供的信息: 自2006年开始招募以来,参与者慷慨地提供了关于他们健康和福祉的各种信息。这包括医学影像、遗传学数据、健康相关记录的链接、生物标志物、活动监测、在线调查问卷等
–影像: 对大约10万参与者进行了大脑、心脏和全身的磁共振成像,以及骨骼和关节的全身DEXA扫描,以及颈动脉的超声检查
–基因学: 对所有参与者进行了基因分型(800,000个全基因组变异和推测到9,000万个变异)、全外显子测序和全基因组测序
–健康相关记录链接: 将参与者的数据与广泛的电子健康相关记录进行关联,包括死亡记录、癌症记录、住院记录和初级护理记录
–生物标志物: 来自所有参与者的超过30个主要生物化学标志物的数据,这些数据来自于招募和第一次重复评估时收集的样本
–在线调查问卷: 收集了关于一系列难以通过常规健康记录评估的曝露和健康结果的数据,包括饮食、食物偏好、工作经历、疼痛、认知功能、消化健康和心理健康等
–重复基线评估: 对10万参与者进行了完整的基线评估
–样本: 从所有参与者采集了血液和尿液,并从10万人中采集了唾液
•要求/限制
–招募邀请的响应率为5%,大大低于许多队列研究
–UK Biobank参与者与英国总体人口相比,社会经济贫苦程度较低,生活方式风险因素较少,长期慢性疾病患病率较低。这对研究共病提出了挑战,特别是与选择偏倚风险相关的问题
3. 数据申请网站:
•UK Biobank官网https://www.ukbiobank.ac.uk/
4. 申请流程:
•第一步:UKB研究人员账号申请
在UKB官网(https://www.ukbiobank.ac.uk/)点击上部的”Researcher login“,再点击链接中的”Sign up to access UK Biobank resources“,输入相关信息,完成后会收到账号激活的邮件。注意,收到激活邮件后仍需要进一步填写研究人员相关信息、所使用的大学或机构邮箱地址、论文发表记录等,完成或会进入”Under review“阶段,由UKB工作人员进行审核,时间大致在2周左右,请耐心等待。
第二步:申请UKB项目及数据使用权限:
UKB数据的使用需要依托项目申请。这需要申请人事先准备好研究项目的Proposal。登陆AMS系统后,点击Applications --> Start New Application,根据要求填写Proposal。
申请提交后,UKB的工作人员会对Proposal进行审核,时间大约需要6-8周。
第三步:提交数据使用协议并支付数据使用费:
申请获批后,UKB的工作人员会以电子邮件通知。申请人需要根据要求填写数据使用协议并付费。目前UKB数据使用费用分为三档,分别是3000英镑/6000英镑/9000英镑。第一档只包含问卷数据和基本的健康数据;第二档包含初步的基因数据;第三档包含额外的WGS/WES/Imaging数据。但即使是第二档数据,也有近40万人样本的Imputation基因数据,质量上乘。